ニセコアンヌプリの登山口というところから町名がニセコ町になったので、駅名もニセコに。旧国鉄時代最初の「カタカナ駅」です。いちばん最初は「真狩駅」でした。後に「狩太駅」に改称され、昭和43年4月1日いまの「ニセコ駅」となりました。